Secretariatul CEPD are sediul la Bruxelles și oferă CEPD sprijin analitic, administrativ și logistic. Aceasta include:
- Pregătirea, redactarea, traducerea și publicarea avizelor CEPD, a deciziilor obligatorii și a altor texte;
- Asigurarea comunicării cu instituțiile europene și cu publicul;
- Furnizarea de soluții informatice pentru - comunicarea între membrii CEPD;
- Organizarea reuniunilor CEPD.
Secretariatul CEPD este compus dintr-un serviciu juridic, un sector al comunicațiilor, o echipă IT și o echipă administrativă.
Personalul Secretariatului este angajat de AEPD și lucrează în conformitate cu instrucțiunile președintelui CEPD. Condițiile de cooperare dintre CEPD și AEPD sunt stabilite prin memorandumul de înțelegere.

